Рекомендую следующую последовательность настройки :
1) Скопировать файлы tor в "C:\Program Files\Tor"
2) Установить tor как службу :
(если ранее устанавливали) sc delete tor
"C:\Program Files\Tor\tor.exe" --service install --options -f C:\ProgramData\tor\torrc
3) Назначить service specific sid
sc sidtype tor unrestricted
4) Создать каталоги данных tor
md C:\ProgramData\tor
md C:\ProgramData\tor\data
md C:\ProgramData\tor\log
5) Назначить права доступа на них
(если русская версия windows - заменить administrators на администраторы)
takeown /r /a /f C:\ProgramData\Tor
icacls C:\ProgramData\Tor /T /reset
icacls C:\ProgramData\Tor /inheritance:r
icacls C:\ProgramData\Tor /grant:r administrators:(OI)(CI)F /grant "NT SERVICE\tor":(OI)(CI)RX
icacls C:\ProgramData\Tor\data /grant "NT SERVICE\tor":(OI)(CI)M
icacls C:\ProgramData\Tor\log /grant "NT SERVICE\tor":(OI)(CI)M
6) Создать свой файл настроек torrc в "C:\ProgramData\tor".
Подробное описание командной строки и файла настроек здесь : https://www.torproject.org/docs/tor-manual.html.en
Пример torrc находится в config_sample.
7) Скопировать файлы geoip в "C:\ProgramData\tor"

Запуск tor :
net start tor
Остановка tor :
net stop tor

Если не стартует - смотрим лог файл в C:\ProgramData\tor\log.
Пробуем запускать без службы : tor.exe -f C:\ProgramData\tor\torrc

Использованы следующие библиотеки :
libevent-2.0.22-stable
openssl-1.0.2a (with enable-ec_nistp_64_gcc_128, no-ssl2, no-ssl3)
zlib-1.2.8
Компилятор - mingw64 GCC 4.9.2.

Добавлена возможность прописать в torrc приоритет процесса Tor :

PriorityClass NORMAL_PRIORITY_CLASS

Возможные значения :
IDLE_PRIORITY_CLASS
BELOW_NORMAL_PRIORITY_CLASS
NORMAL_PRIORITY_CLASS
ABOVE_NORMAL_PRIORITY_CLASS
HIGH_PRIORITY_CLASS
Если вы на 2-ядерном процессоре и tor.exe потребляет более 25% ресурсов - рекомендую ставить BELOW_NORMAL_PRIORITY_CLASS.